病毒純化和蛋白質(zhì)純化都是生物制劑工程中常見的分離純化方法，但它們的對象不同，具體區(qū)別如下：
1.病毒純化與蛋白質(zhì)純化對象不同。病毒純化的目標是將病毒從其它生物物質(zhì)中進行分離和去除，以獲得單個且純凈的病毒顆粒，如用于疫苗生產(chǎn)的病毒載體，而蛋白質(zhì)純化的目標是從生物體或來源中提取和純化單一或多種蛋白質(zhì)，如酶、蠶絲素和飲料中的植物蛋白等。
2.病毒純化需要不同的處理方式。病毒由于結(jié)構(gòu)上的特殊性，需要經(jīng)過多種方式進行提取和純化，通常采用的是離心、超濾、沉淀、分層、純化和表征等方法。而蛋白質(zhì)純化通常采用的是色譜層析、電泳、沉淀和凝膠等特定的分離方法。
3.純化手段不同。由于病毒粒子小而復(fù)雜，因此用于純化病毒的方法通常需要采用多種手段，如超離心、離心、過濾和分層等。而蛋白質(zhì)純化的方法也是不同的，例如，利用離子交換和親和色譜等方法將目標蛋白質(zhì)分離和純化出來。
4.純度或雜質(zhì)的標準不同。病毒純化需要獲得極高的純度水平，以確保病毒質(zhì)量和感染性，而對于蛋白質(zhì)純化，可以根據(jù)其具體應(yīng)用來標準純度水平。因此，在提取和純化病毒時，要求其完全純凈，而在純化蛋白質(zhì)時，這種要求可以更靈活。
